Společenství starokatolíků se v krajské Jihlavě scházelo původně v kostele sv. Pavla, Dvořákova ul., Českobratrské evangelické církve od 1. neděle adventní roku 2003. Farní obec vznikla ve městě, kde starokatolictví nemá žádnou historickou tradici. Nedělní bohoslužby se pravidelně konají v 10:30 hodin. Farní obec má přibližně 32 zaevidovaných stabilních členů. Duchovní správa zahrnuje ještě další sympatizující věřící a členy farní obce z okolních měst a vesnic roztroušených po Vysočině, proto je nutno chápat duchovní správu v Jihlavě v územně širším slova smyslu. Jihlavská starokatolická obec byla 17.11.2004 zaregistrována Ministerstvem kultury ČR jako filiální obec farní obce Havlíčkův Brod a k 15.11.2005 se stala samostatnou farní obcí.
Pod vedením sbormistra a středoškolského pedagoga Jaroslava Beneše je zde činný chrámový sbor, který se aktivně podílí na kulturním dění v Jihlavě i okolí a postupně se rozšiřuje. Během roku se koná několik koncertů sboru v Jihlavě v kostelích jednotlivých církví, čímž se snažíme vytvářet v duchu ekumény přátelské prostředí. V roce 2005 byly zavedeny pro širokou veřejnost občasné večery s hudbou a pozvaným hostem. V květnu 2005 byl v Jihlavě hostem bratr biskup Dušan Hejbal. V roce 2006 se ve všech obdobích roku pravidelně zavedly přednáškové večery na téma Putování církevními a kulturními dějinami, které se těší zájmu nejen věřících, ale i široké veřejnosti.
Od 1.11.2007 se pravidelné bohoslužby ve Farní obci Starokatolické církve v Jihlavě konají v kostele Povýšení sv. Kříže (CČSH) v Křížové ulici. Farní obec uzavřela smlouvu o užívání kostela Povýšení sv. Kříže s Náboženskou obcí Církve československé husitské v Jihlavě ke dni 1.1.2008.
Slavnostní poutní bohoslužba na památku založení farní obce v Jihlavě je konána za účasti br. biskupa Dušana Hejbala v neděli okolo svátku Povýšení sv. Kříže.
Farní obec v Jihlavě zajisté nepatří mezi početně největší obce naší církve, ale vládne zde duch přátelství a pomoci mezi věřícími a s velikou radostí v srdci se scházíme ke společným bohoslužbám s vědomím, že nejsme sami a Bůh je uprostřed nás.